Wenn ihr den Strand damit quasi "abgehakt" habt und sowieso noch Zeit auf den Philippinen verbringen wollt, dann bleibt euch für was anderes ja gar nicht mehr viel Zeit.
Von wo wollt ihr denn rüberfliegen? KL? SG?
Spontane Idee wäre aus meiner Sicht:
HH -> KL -> Melaka -> Singapur -> Philippinen -> KL -> HH
Wenn ihr eher keinen Bock auf Singapur habt und eher Dschungel vorzieht, dann würd ich alternativ von KL aus nen Abstecher in die Taman Negara machen. Je nachdem wieviel ihr individuell und wieviel ihr organisiert machen wollt, habt ihr davor/danach auch noch Zeit für nen kurzen Abstecher nach Melaka.
Flüge/Reiseweg wär dann natürlich HH -> KL (City, Taman Negara, Melaka) -> Philippinen -> KL -> HH
Zu den Philippinen kann ich leider nichts sagen, da ich da noch nicht war...