Ausgelost werden Paarungen am Sonntag, 29. Oktober, in der ARD-Sportschau. Die Sendung beginnt um 18 Uhr. Ab dem Achtelfinale werden die Paarungen aus einem Lostopf gezogen. Der zuerst gezogene Verein hat Heimrecht, es sei denn, an einer Spielpaarung nimmt ein Amateurligist teil. Sollte dieser in einer Partie gegen eine Lizenzspielermannschaft an zweiter Stelle gezogen werden, wird das Heimrecht getauscht.
Die weiteren Termine im DFB-Vereinspokal 2006/2007
Achtelfinale: 19./20. Dezember 2006
Viertelfinale: 27./28. Februar 2007
Halbfinale: 17./18. April 2007
Finale: 26. Mai 2007 in Berlin
Quelle: bvb.de